1 अगस्त, 2022 तकलेक्सी अर्ली

हमारे प्रौद्योगिकी प्लेटफॉर्म: जीनोमिक्स

अगले कुछ हफ्तों में हम अपने विभिन्न प्रौद्योगिकी प्लेटफार्मों, उनके काम और शोध, और शोधकर्ताओं के लिए उपलब्ध सुविधाओं के बारे में कहानियां पेश करेंगे। ये हमारे में भी चित्रित हैं2021 वार्षिक रिपोर्ट . सबसे पहले, हम जीनोमिक्स सुविधा को देखते हैं: डीप सेक।

फ्यूचर फूड बीकन ने डीप सेक की सीक्वेंसिंग क्षमता और क्षमता बढ़ाने के लिए उपकरणों की कई वस्तुओं में निवेश किया। नए उपकरणों में नैनोपोर ग्रिडियन X5, 10X क्रोमियम कंट्रोलर, टीटीपी लैबटेक मॉस्किटो एचवी रोबोट, बायोनानो सैफायर और इन-फील्ड अनुक्रमण के लिए एक उपन्यास पोर्टेबल फील्ड किट का विकास शामिल है। यह उपकरण कोविड -19 के दौरान विशेष रूप से उपयोगी साबित हुआ है, क्योंकि डीप सेक कोविड -19 जीनोमिक्स यूके कंसोर्टियम (सीओजी-यूके) का हिस्सा बन गया है, जो 10,000 वायरल जीनोम का अनुक्रमण करता है, जिसका उपयोग संचरण के पैटर्न और वेरिएंट के उद्भव की पहचान करने के लिए किया गया है। स्थानीय, राष्ट्रीय और वैश्विक स्तर पर। फ्यूचर फूड बीकन टेक्नोलॉजिस्ट, डॉ क्रिस्टोफर मूर, इस काम को करने वाली टीम के मुख्य सदस्य रहे हैं, और नमूने चलाने के लिए ग्रिडियन का उपयोग कर रहे हैं। डीप सेक की टीम को हाल ही में कोविड -19 के खिलाफ लड़ाई में उनके योगदान के लिए कुलपति के पदक से सम्मानित किया गया है। क्रिस अब एक कोविड -19 अपशिष्ट जल निगरानी परियोजना पर काम कर रहे होंगे, जो आबादी में कोविड संक्रमण की निगरानी के प्रयास में अपशिष्ट जल का अनुक्रमण करेगा।

टीटीपी लैबटेक मच्छर एचवी रोबोट, अनुक्रमण के डीप सेक द्वारा उपयोग किए जाने वाले उपकरण का हिस्सा

साथ ही कोविड -19 अनुक्रमण पर काम करते हुए, क्रिस ने बीकन के लिए कई अनुक्रमण परियोजनाएं भी दी हैं। इनमें पूर्वी एशिया के अर्ध-शुष्क क्षेत्रों में एक महत्वपूर्ण फसल फॉक्सटेल बाजरा की 300 लाइनों के उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण के लिए मच्छर एचवी रोबोट का उपयोग करना शामिल है। इस डेटा सेट का उपयोग जीनोम वाइड एसोसिएशन स्टडी (जीडब्ल्यूएएस) में किया जाएगा ताकि यह पता लगाया जा सके कि फसल के लक्षण उनके अंतर्निहित आनुवंशिक मेकअप से कैसे प्रभावित होते हैं। क्रिस ने मोथ बीन के जीनोम को भी अनुक्रमित किया है, जो आमतौर पर भारत में उगाई जाने वाली सूखा प्रतिरोधी फसल है। यह अनुक्रमण ग्रिडियन और इलुमिना नेक्स्टसेक पर किया गया था और इसने डेटा प्रदान किया है जिसका उपयोग मोथ बीन की सूखा सहनशीलता को समझने में मदद करने के लिए किया जा सकता है और इसे दुनिया के अन्य शुष्क क्षेत्रों में उपयोग के लिए फसल के रूप में सुधारने के लिए किया जा सकता है। फ्यूचर फूड इक्विपमेंट इन्वेस्टमेंट ने औद्योगिक सहयोग को भी सक्षम किया है, जिसमें एक वाणिज्यिक बीज उत्पादक के साथ उनकी F1 हाइब्रिड लाइनों में से एक के जीनोम को अनुक्रमित करने के लिए और ऑक्सफोर्ड नैनोपोर, इलुमिना और बायोनानो सैफिर प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके पार्सनिप की दो पैतृक लाइनें शामिल हैं।

क्षेत्र में उपयोग के लिए क्रिस द्वारा डिजाइन की गई अनुक्रमण किट

इन-फील्ड अनुक्रमण किट के विकास ने शोधकर्ताओं को प्रयोगशाला के बजाय क्षेत्र में अनुक्रमण करने की अनुमति दी है। किट एक नमूने को संसाधित करने के लिए आवश्यक सभी उपकरणों से सुसज्जित है और इसे एक कॉम्पैक्ट सूटकेस में निहित शक्ति या प्रयोगशाला सुविधाओं तक सीमित पहुंच के साथ अनुक्रमित करता है। यह कोको किण्वन की जांच करने वाली हमारी परियोजना पर शोधकर्ताओं द्वारा परीक्षण के लिए रखा गया था। कोकोआ की फलियों को किण्वित करने में शामिल रोगाणुओं का ऑन-फार्म डीएनए अनुक्रमण कोलंबिया के दूरदराज के खेतों में आयोजित किया गया था, जिससे साबित होता है कि तकनीक का इस्तेमाल वास्तविक समय में खेतों पर कोको किण्वन की निगरानी के लिए किया जा सकता है।

कोलम्बियाई कोको फार्म पर क्रिस मूर और डेविड गोपॉलचन जहां उन्होंने हमारी अनुक्रमण किट का उपयोग किया

डीप सेक के साथ काम करने के इच्छुक शोधकर्ता ऐसा कर सकते हैंयहां . डीप सेक को फॉलो करेंट्विटर.

प्रकाशित किया गया थाखाद्य अनुसंधान